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华为、华西医院、赛乐基因联合发布“多组学数据加速分析平台”

近来,在“四川大学125周年校庆活动暨第七届生物医学大数据·智能技能使用峰会”开幕式上,四川大学华西医院、华为技能有限公司、赛乐基因科技(北京)有限公司联合发布多组学数据加快剖析渠道。该渠道根据GPU加快,集数据存储、核算、办理、使用为一体,旨在推进基因测序技能立异,加快医疗职业数字化转型。

现在,根据该渠道现已取得严重阶段性开展:30X人类WGS胚系变异剖析时刻从24小时缩短至7分钟,这是全球初次将人类全基因组剖析推进至分钟级年代,在多组学数据剖析范畴具有跨年代的含义。

跟着新一代基因测序技能(Next Generation Sequencing,NGS)和测序仪的开展,基因测序速度不断提高,测序本钱不断下降,人类全基因组的测序本钱从曩昔的30亿美金现已下降到500美金,由此带来了基因相关科学研究和使用的快速开展,现在基因测序技能现已在生育健康、肿瘤个体化确诊和医治、遗传病、流行症检测、疫苗研制等范畴取得广泛的使用,为精准医疗和个性化医疗带来很多革命性立异。

与基因职业的快速迸发相对应,基因测序数据则出现指数级增加趋势,未来有或许比肩地理数据量。当时每台最先进的基因测序仪每天发生的测序数据现已到达6TB,每年发生的数据则高达数十PB,且需求永久保存。为了及时剖析这些海量的基因数据,测序企业和科研机构往往需求投入高额资金建造高性能核算集群和数据中心。因而,基因数据的剖析速度与本钱日益成为掣肘基因测序职业开展的关键因素。怎么提高基因数据的剖析功率、降低本钱投入成为业界公认有必要处理的新课题。

此次三方立异协作,充分发挥了华西医院在多模态组学数据剖析和基因使用等范畴的抢先学术和工业优势,华为公司在高性能数据存储和先进基因数据办理体系上的技能堆集,以及赛乐基因在GPU加快生物信息数据剖析范畴的职业经历。面向未来,三方的立异协作有望在基因测序范畴,以数据为驱动,以立异为引擎,加快数据与存储技能赋能生物科技工业,促进乃至引领医疗职业的数字化革新。

“多组学大数据年代现已到来,华西医院多组学数据加快剖析渠道立异性地引进华为OceanStor Pacific面向多样化算力的交融剖析数据底座,以及赛乐基因BaseNumber基因数据剖析GPU加快计划,推进多组学数据剖析迈入分钟级年代。”华西医院数据科学家于浩澎博士在下午的讲演中说到,“此项研究成果的发布,将加快精准医疗大数据在医学上的广泛使用。”

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